Fakultas Teknik Informasi (FTI) UKSW baru didirikan tahun 2003 SK YPTKSW No.023/SK/BPH-UKSWIXV/2002 dan SK No. 004/5K/BPH-UKSW/111/2003. Pada awalnya, FTI UKSW hanya memiliki 1 program studi yaitu S1 Teknik Informatika (Surat Ijin Penyelenggaraan No 1868/D/T/2002) yang mulai beroperasi pada tahun ajaran 2003/2004. Namun sejak itu, FTI UKSW telah berkembang pesat dengan memiliki 10 Program Studi hanya dalam kurun waktu 17 tahun. Hal ini tidak terlepas dari VMST FTI UKSW yang ingin menjadi salah satu yang terbaik di tingkat nasional maupun internasional. Dari 10 Program studi FTI UKSW, 5 program studi mendapatkan peringkat akreditasi A, 4 Program Studi mendapatkan peringkat akreditasi B dan 1 program studi (program studi S3 Ilmu Komputer) dalam pengajuan akreditasi. Program studi S3 Ilmu Komputer baru memulai menerima mahasiswa pada tahun ajaran 2019/2020. FTI UKSW menyadari bahwa keberhasilan pencapaian VMTS FTI sangat ditentukan oleh keberadaan suatu sistem tata pamong. FTI UKSW memiliki tata pamong yang sangat baik untuk membangun sistem yang kredibel, transparan, akuntabel, bertanggung jawab, dan adil. Sistem tata pamong di FTI UKSW mengacu pada STATUTA UKSW tahun 2016 (SK YPTKSW No 248/B/YSWIXI/2016) dan dijabarkan dalam mekanisme kerja Fakultas yang disahkan berdasarkan SK Rektor No. 132/kep/Rek. /4/2015, dimana struktur organisasi yang dijabarkan sudah efektif dan efisien karena keseluruhan aktivitas yang ada dalam operasionalisasi FTI telah tercermin dalam masing-masing fungsi yang diatur didalam mekanisme kerja, serta tidak ada rangkap tugas dalam masing-masing bagian (struktur organisasi terdapat dalam dokumen mekanisme kerja).
Karena baru mulai beroperasi pada tahun akademik 2019/2020, maka jumlah mahasiswa program studi S3 Ilmu Komputer masih terbatas sebanyak 13 orang yang direkrut dari 30 orang pendaftar. Mahasiswa program studi S3 Ilmu Komputer berasal dari pengajar universitas di berbagai provinsi di Indonesia, yaitu Jawa Tengah (Universitas Stikubank, Universitas Semarang, Universitas STEKOM, STIMIK Widya Pratama), Yogyakarta (Amikom Yogyakarta) dan Papua (Universitas Cendrawasih).